信息工程學(xué)院的創(chuàng)建始于1978年，在交通部的支持下, 上海海運學(xué)院成立電子計算機計算技術(shù)專業(yè)籌建小組，于1979年正式成立電子計算機計算技術(shù)專業(yè)并招收第一屆本科學(xué)生；1985年成立計算機科學(xué)系，并招收第一屆計算機應(yīng)用碩士研究生；1990年計算機及應(yīng)用專業(yè)獲得計算機應(yīng)用工學(xué)碩士學(xué)位授予權(quán)，成為當時交通部部屬高校中唯一的計算機專業(yè)碩士點，也是上海地區(qū)較早擁有計算機應(yīng)用碩士點的高校之一；1997年學(xué)校將計算機科學(xué)系、電子工程系、電氣工程系和機械工程系合并成立工學(xué)院；2003年，電子系和計算機系從工學(xué)院中分出，成立信息工程學(xué)院。

　　學(xué)院現(xiàn)有電子信息工程、通信工程、計算機科學(xué)與技術(shù)、網(wǎng)絡(luò)工程、信息管理與信息系統(tǒng)、人工智能6個本科專業(yè)，其中人工智能專業(yè)為2020年新增，于2020年的秋季參與全國招生。學(xué)院擁有信息管理與信息系統(tǒng)二級學(xué)科博士點；計算機科學(xué)與技術(shù)、信息與通信工程2個一級學(xué)科學(xué)位點；計算機應(yīng)用技術(shù)、計算機軟件與理論、計算機系統(tǒng)結(jié)構(gòu)、信號與信息處理、通信與信息系統(tǒng)5個二級學(xué)科學(xué)位點。電子信息1個專業(yè)學(xué)位類別，計算機技術(shù)、電子與通信工程、軟件工程3個專業(yè)學(xué)位領(lǐng)域。設(shè)有計算機科學(xué)、電子工程2個教學(xué)系，以及信息基礎(chǔ)教學(xué)部、實驗中心以及航運信息技術(shù)研究所。

　　學(xué)院主要科研方向：信息工程基本理論與方法, 高性能和智能海洋與航運信息技術(shù)，海洋通信與網(wǎng)絡(luò)技術(shù)，海洋探測信息技術(shù)，生物信息技術(shù)及其在航運和海洋學(xué)科方面的應(yīng)用和水下機器人技術(shù)及應(yīng)用等。先后承擔國家863計劃項目、國家自然科學(xué)基金項目、國防預(yù)研、交通部和上海市自然科學(xué)基金等重大課題以及企業(yè)委托的科研課題，獲得可喜的研究成果。

　　學(xué)院現(xiàn)有教職員工140名，其中專任教師110名，含博士學(xué)位獲得者90名、教授16名、副教授39名，其中，碩士研究生導(dǎo)師70人，博士研究生導(dǎo)師8人。在讀學(xué)生2470人，其中研究生679人，本科生1791人。